2010年12月,公司完成企业集团设立,并变更母公司名称为中铁港航局集团有限公司。
中铁港航工程局有限公司的前身是广东中海工程建设总局,是原海后生产管理部的一支筑港部队。
1999年,我局响应中央关于军队不再从事经商活动的号召,成建制移交地方并入三九企业集团管理。
2008年11月28日经国资委批准,原广东中海工程建设总局从华润集团总公司划转到中国铁路工程总公司。
2010年3月,公司资产整体并入中国中铁股份有限公司。
2010年10月,股份公司进行战略性重组,将原中铁五局三公司、中铁大桥局三公司等2家三级子公司和中铁二局深圳公司部分项目及人员重组并入中铁港航工程局有限公司。